Не важно, по какой форме обучаются студенты. В соответствии с приказом 464 консультации относятся к учебным занятиям. Соответственно и учитывать их нужно как учебные занятия, выделяя время на них из общего фонда часов. В заочной форме может быть только одна особенность — консультации в межсессионный период. Это тоже занятия, тоже из общего фонда часов, только проводить их можно дистанционно. В таком случае вы разрабатываете положение об оплате дистанционных занятий.
Главное отличие от ФГОС 3+: дополнительных часов на консультации не выделяется. Все входит в общий фонд часов