Вы имеете право принять студентов на 2 курс. Если обучение по профессии/специальности ведется, то лицензия у образовательной организации есть, значит, есть и право ведения образовательной деятельности. Соответственно, обучение можно вести на любом курсе вплоть до выпускного.