Журнал и экзамен
Это зависит только от вашего локального акта — порядка ведения (или заполнения) журналов. Графа с экзаменом может как вноситься, так и не вноситься в журнал, причем можно это делать независимо от версии ФГОС.
Если вы выставляете окончательную оценку, которая в итоге идет в диплом, в журнал, то логично и экзаменационную оценку в журнале обозначить.
Федеральными приказами этот вопрос не регулируется. Вполне может быть, что у вас журнал ведется только для учета посещаемости и текущего оценивания, а вся ПА выносится в ведомости и зачетки.
Как пропишете в своем локальном акте, так и будет правильно